Fenotipado Clínico y Molecular (CMP)

Línea 1. Diagnóstico molecular relacionado con infecciones y paneles de biomarcadores del huésped y el patógeno. Esta línea se ampliará más allá de los marcadores derivados del huésped para incorporar ARN no codificantes derivados del patógeno, un área innovadora y poco explorada con un gran potencial traslacional. Las prioridades incluyen: i) miARN virales como indicadores de reactivación viral en pacientes críticos y con COVID prolongado, ii) fragmentos derivados del ARNt para el diagnóstico precoz de la aspergilosis pulmonar invasiva, y iii) paneles combinados de ARN no codificante derivado de bacterias y del huésped para informar sobre la resistencia a los antimicrobianos. Estas líneas de investigación están alineadas con los grupos del ecosistema CIBERES/CIBERINFEC. Cuando se identifiquen señales sólidas y de gran impacto en cohortes humanas, se llevarán a cabo estudios mecánicos específicos para reforzar la plausibilidad biológica y, cuando sea apropiado, explorar vías de acción y posibles dianas terapéuticas.
Línea 2. Endotipado molecular y estratificación del riesgo en síndromes respiratorios y de cuidados intensivos. El grupo desarrollará endotipos moleculares multicapa para mejorar la estratificación de los pacientes con enfermedades respiratorias y síndromes relacionados con la UCI. Basándose en cohortes establecidas y en la actividad multicéntrica dentro del CIBERES (incluido el liderazgo en paquetes de trabajo relacionados con el COVID prolongado), el grupo identificará perfiles moleculares asociados a resultados clínicamente relevantes (síntomas persistentes, deterioro de la función pulmonar, complicaciones) y los traducirá en paneles de biomarcadores adecuados para la evaluación clínica.
Línea 3. Métodos, reproducibilidad y ciencia de la implementación para biomarcadores de ARN. El grupo dirigirá un programa estructurado sobre estandarización y reproducibilidad, ampliando la actividad internacional de ensayos cruzados en curso a un marco de calidad más amplio para los procesos de ARN circulante (variables preanalíticas, extracción/normalización, umbrales de notificación y análisis de datos). Los resultados incluirán procedimientos operativos estándar armonizados y recomendaciones consensuadas vinculadas a COST que permitan la comparabilidad entre laboratorios.