Lipidómica

Para alcanzar estos objetivos la plataforma lipidómica ofrece apoyo técnico y asesoramiento a los grupos de investigación que lo soliciten sobre las posibles aplicaciones experimentales, así como el procesamiento de las muestras para cada una de las aplicaciones. Ponemos a punto y optimizamos los protocolos para los diferentes análisis requeridos por el personal usuario y nos encargamos también del procesamiento y análisis de datos.

La plataforma lipidómica consta de dos equipos HPLC (Cap Pump 1200 Serues G1376A, Nano Pump 1200 Series G2226A, Agilent Technologies), dos equipos UPLC (Agilent 1290 Infinity Quaternary Pump), dos sistemas de detección de masas QTOF (QTOF LC/MS G6520A y 6545, Agilent Technologies), un sistema de detección de masas TQD (Triple Quad 6420 LC/MS Agilent Technologies), un sistema de ionización en nanoelectroesprai mediante tecnología Chip Cube (HPLC Chip Cube G4240A, Agilent Technologies) y el software necesario para el análisis bioinformático de los datos metabólicos generados en dicha plataforma (MassHunter Data Adquisition, MassHunter Qualitative Analysis, MassHunter Quantitative Analysis, MassHunter Mass Profiler, Agilent Technologies). La plataforma está ubicada parcialmente en el Instituto de Investigación Biomédica de Lleida, Edificio Biomedicina 2, planta 4, y parcialmente en la H3 del Parque Científico y Tecnológico Agroalimentario de Lleida (PCiTAL), en el espacio denominado "Plataforma de Servicios Cientificotécnicos".

Proyecto PLICAT (expediente código oficial de la ayuda número IU16-015805)

Este servicio cuenta con el apoyo del Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER), concedido por la Secretaria de Universidades e Investigación del Departamento de Empresa y Conocimiento de la Generalitat de Cataluña, para desarrollar y consolidar la Plataforma Lipidómica de Cataluña (PLICAT). PLICAT quiere ser referente en el estudio de los lípidos (grasas) en la investigación biomédica, así como en estudios de la industria farmacéutica y alimentaria. Se trata de una plataforma de alta tecnología que integra diferentes equipaciones científicas complementarios de vanguardia que permiten el estudio cumplido del lipidoma (perfil completo de lípidos) de una muestra biológica (sangre, célula, tejido u organismo, entre otros).

El objetivo es consolidar y constituir la Plataforma Lipidòmica de Cataluña(PLICAT). Se requiere de una plataforma lipidómica de gran calidad que integre diferente equipos complementarios para asegurar la identificación, cuantificación y análisis bioinformático del lipidoma. PLICAT quiere constituirse y convertirse en un imán para las partes interesadas en la lipidómica, del mundo académico y la industria, ofreciendo nuevas tecnologías y instalaciones de vanguardia y capital intelectual. Como centro de referencia lipidómica, los objetivos específicos y retos por los próximos años son:

• Definir perfil lipídicos por tipo celular, tejido, órgano, especie, condición fisiológica, condición patológica, poblaciones de riesgo, efectos de intervenciones nutricional, farmacológicas y genéticas, etc.
• Participar en la construcción de bases de datos de lípidos y ayudar al desarrollo futuro de la lipidómica.
• Detectar e identificar biomarcadores lipídicos.
• Implementar herramientas por la integración de la lipidómica con otros enfoques ómicos, muy especialmente, la transcriptómica y la genómica. Así, por ejemplo, queremos entender como la variación genética se relaciona con la variación de los metabolitos lipídicos en los niveles de individuos y poblaciones.
• Definir paneles de lípidos por aplicaciones específicas.
• Diseñar aplicaciones en medicina y ciencias ambientales-agroalimentarias basándonos en la definición de perfiles lipídicos e improntas lipidómicas.
• Optimizar el manejo de la gran cantidad de datos de experimentos de espectrometría de masas y cromatográficos y cubrir las grandes demandas computacionales y bioinformáticas tanto en la adquisición como en el procesamiento de datos.
• Impulsar la investigación en tecnología y biología de lípidos.
• Desarrollar los estudios de lipidómica y proporcionar una plataforma para la colaboración y la investigación internacionales.
• Fomentar y participar activamente en la formación lipidómica.
• Organizar acontecimientos para fomentar la investigación interdisciplinaria con base lipidómica.

Este proyecto ha sido cofinanciado por la Unión Europea intermediando el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) con el apoyo de la Secretaría de Universidades e Investigación del Departamento de Empresa y Conocimiento de la Generalitat de Cataluña, y la colaboración institucional de la Universitat de Lleida (UdL), la Fundació Centre de Recerca en Agrotecnologia (Agrotecnio) y de Gestió de Serveis Sanitaris-Aliança Estratègica ICS-GSS.