Servicios científico técnicos
Bioinformática y Biología Computacional (BIO2COMP)
Servicio ubicado en el edificio de Biomedicina que ofrece formación, consultoría y análisis en bioinformática y en biología computacional.
Servicios
1.- En Bioinformática
Formación y consultoria
- Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades bioinformáticas en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior.
- Formación personalizada y de grupo en Bioinformática y modelización matemática.
- Asesoría y soporte a los usuarios de herramientas y métodos bioinformáticos.
Análisis estándar
- Ensamblaje de novo y anotación de genomas procarióticos.
- Análisis de variantes con genoma de referencia en procariotas y eucariotas.
- Análisis de expresión genética (MicroArray & RNAseq) para identificación de genes con expresión diferencial.
- Análisis y optimización de expresión de secuencias biológicas (uso de codones más frecuentes).
- Modelización y predicción de estructuras de proteínas.
- Visualización de datos en mapas de redes biológicas.
Análisis especializados
- Análisis cualitativo y cuantitativo de resultados de experimentos ómicos.
- Análisis de datos.
- Otros proyectos no estándar.
2.- En Biología Computacional
Formación y consultoría
- Servicios de consultoría a los investigadores para el planteamiento de actividades de biología computacional en la solicitud de financiación de proyectos y en la planificación de sus experimentos con vistas a un adecuado tratamiento bioinformático posterior.
- Formación personalizada y de grupo en métodos de biología computacional.
- Asesoría y soporte a los usuarios en la utilización de software de modelización matemática en biología, biomedicina y biotecnología.
Análisis especializados
- Creación de "digital twins" de procesos biológicos para análisis y optimización de los mismos.
- Modelos compartimentales.
- Análisis de sensibilidades y evaluación de escenarios 'what if...' (in silico experiments)
Equipamientos
- 2 Servidores, cada uno con 2 procesadores Intel Xeon (24 nodos de computación) a 2.0 GHz, 124 GB RAM, para cálculos intensivos.
- 4 workstations HP serie Z, con procesadores intel Xeon y 8 nodos de computación.
- 3 PC de altas prestaciones HP.
Detalles del contacto
Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves
973 702 425
rui.alves(ELIMINAR)@udl.cat
Departamento de Ciencias Médicas Básicas
Facultad de Medicina / Edificio Biomedicina / Laboratorio 4.11
Av. Rovira Roure 80, 25198 Lleida
Equipo
-
Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves
-
Jorge Sebastian Comas Pereyra
-
Alberto Marin Sanguino
-
Albert Sorribas Tello
-
Ester Vilaprinyó Terre