Bioinformàtica i Biologia Computacional (BIO2COMP)

Serveis
1.- En Bioinformàtica

Formació i consultoria

• Serveis de consultoria al personal investigador per al plantejament d'activitats bioinformàtiques en la sol·licitud de finançament de projectes i en la planificació dels seus experiments amb vista a un adequat tractament bioinformàtic posterior.
• Formació personalitzada i de grup en Bioinformàtica i modelització matemàtica.
• Assessoria i suport als usuaris d'eines i mètodes bioinformàtics.

Anàlisi estàndard

• Assemblatge de novo i anotació de genomes procariòtics.
• Anàlisi de variants amb genoma de referència en procariotes i eucariotes.
• Anàlisi d'expressió genètica (Bioxip & RNAseq) per a identificació de gens amb expressió diferencial.
• Anàlisi i optimització d'expressió de seqüències biològiques (ús de codons més freqüents).
• Modelització i predicció d'estructures de proteïnes.
• Visualització de dades en mapes de xarxes biològiques

Anàlisis especialitzades

• Anàlisi qualitativa i quantitativa de resultats d'experiments òmics.
• Anàlisi de dades.
• Altres projectes no estàndard.

2.- En Biologia Computacional

Formació i consultoria

• Serveis de consultoria al personal investigador per al plantejament d'activitats de biologia computacional en la sol·licitud de finançament de projectes i en la planificació dels seus experiments amb vista a un adequat tractament bioinformàtic posterior.
• Formació personalitzada i de grup en mètodes de biologia computacional.
• Assessoria i suport als usuaris en la utilització de programari de modelització matemàtica en biologia, biomedicina i biotecnologia.

Anàlisis especialitzades

• Creació de "digital twins" de processos biològics per a anàlisis i optimització d'aquests.
• Models compartimentals.
• Anàlisi de sensibilitats i avaluació d'escenaris 'what if...' (in silico experiments).

Equipaments

• 2 Servidors, cadascun amb 2 processadors Intel Xeon (24 nodes de computació) a 2.0 GHz, 124 GB RAM, per a càlculs intensius.
• 4 workstations HP seriï Z, amb processadors intel Xeon i 8 nodes de computació.3 PC d'altes prestacions HP.